Katedra Limnologii UG jest wydawcą serii Badania Limnologiczne (Limnological Research), w ramach której publikowane są opracowania o charakterze monograficznym prezentujące rezultaty prowadzonych przez jednostkę badań jeziornych. Na szczególną uwagę zasługują atlasowe opracowania ekosystemów jeziornych niewielkich obszarów lub regionów geograficznych, a w odniesieniu do terytorium całego kraju Baza danych jezior Polski i jej wykorzystanie w badaniach limnologicznych powstała w ramach międzyuczelnianego projektu badawczego.
Ponadto w Katedrze znajduje się redakcja Limnological Review oficjalnego czasopisma Polskiego Towarzystwa Limnologicznego.

• Atlasy jezior obszarów chronionych województwa pomorskiego

• Publikacje o charakterze monograficznym

• Podręczniki i przewodniki metodyczne

• Inne publikacje

• Publikacje pracowników Katedry Limnologii UG:

• dr hab. Dariusz Borowiak

• dr Magdalena Borowiak

• dr Kamil Nowiński

• dr Jacek Barańczuk